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抗击新冠病毒:NVIDIA免费开放GPU基因组测序软件

2020-3-22 21:49| 发布者: cjy__05| 查看: 1474| 评论: 10|来自: 驱动之家

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摘要: 为应对新冠病毒疫情,NVIDIA宣布,将向全球所有COVID-19新型冠状病毒研究人员免费提供90天的Parabricks软件使用权。

为应对新冠病毒疫情,NVIDIA宣布,将向全球所有COVID-19新型冠状病毒研究人员免费提供90天的Parabricks软件使用权。

NVIDIA Parabricks软件基于著名的Genome Analysis Toolkit工具包,可通过GPU加速计算,将序列数据分析的速度提高50倍。

目前,各地科研人员正在对新状病毒和COVID-19感染者的基因组进行测序,以了解疾病的传播方式并确定易感染人群,但分析基因组序列需要耗费大量的时间和计算力。

Parabricks团队去年12月刚刚加入NVIDIA,他们的软件可以在一台服务器上快速分析一个人的全部基因组变异,并且将分析时间从传统的几天,缩短至一个小时以内。

鉴于此次疫情史无前例的传播速度,如此巨大的提速无疑将对了解病毒进化、疫苗开发带来巨大的推动作用。

NVIDIA也在联系云服务供应商和超级计算中心,争取提供更多的计算资源和Parabricks访问途径。

不过,只有使用NVIDIA GPU,才能申请并获得Parabricks软件的使用权。

另外,使用Oxford Nanopore long-read数据的研究人员,可以GitHub上找到GPU加速工具存储库,以下应用也已内置NVIDIA GPU加速功能:MedakaRaconRaven ReticulatusUnicycler

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引用 2020-3-28 22:18 PCBETA网友 222.133.*.*
哦,现在发善心了
引用 2020-3-28 12:03 PCBETA网友 112.49.*.*
不明觉厉
引用 2020-3-26 23:08 PCBETA网友 60.5.*.*
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进来看一看
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计算结果会给大家一起用吗
引用 2020-3-24 18:27 PCBETA网友 222.94.*.*
都是云计算,
然后小湾湾免费得到计算结果
引用 2020-3-24 13:27 PCBETA网友 49.76.*.*
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支持
引用 2020-3-23 19:31 PCBETA网友 221.214.*.*
这个就算了吧。
引用 2020-3-23 07:01 PCBETA网友 58.20.*.*
如果支持分布式计算,大家都没有开电脑帮下忙

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